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L'APEMM a toute capacité pour gérer les CIR, subventions, contrats, partenariats et dons, ainsi que les dotations de prix scientifiques qui récompensent le travail d'un chercheur ou d'une équipe. 

Les frais de gestion sont réduits, La gestion administrative et comptable est assurée par une équipe resserrée.

En effet, Bureau et Conseil scientifiques, composés de biologistes et de médecins chercheurs renommés, reconnus par la communauté scientifique, exercent leur mission auprès de l'APEMM à titre entièrement bénévole. 

Une gestion rigoureuse pour des financements d'origines diverses

La gestion par l'APEMM est transparente :

• rigoureuse et détaillée, elle fait ressortir les éléments fiscaux (TVA, éligibilité CIR...) ;
• les comptes sont certifiés par un commissaire aux comptes.
  

Selon les cas (subvention, dotation...), les financements ne sont pas soumis à la même fiscalité, certains sont soumis à la TVA, d'autres non.  

Types de fonds gérés par l'APEMM :

• subventions, contrats, partenariats et crédits privés, notamment projet R&D éligible au Crédit d'impôt Recherche (CIR),
  
  
• dotations de prix scientifiques récompensant des chercheurs ou des équipes, 
  
  
• dons et legs.